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迄今最大規(guī)模血漿蛋白質(zhì)組研究出爐 深入了解人類(lèi)疾病和其他表型
2021-12-03 14:02:38來(lái)源: 科技日?qǐng)?bào)

在2日發(fā)表于英國(guó)《自然·遺傳學(xué)》雜志上的一項(xiàng)研究中,安進(jìn) (Amgen)制藥屬下deCODE基因公司的科學(xué)家們展示了通過(guò)結(jié)合序列多樣性和RNA表達(dá)的數(shù)據(jù),測(cè)量出迄今最大規(guī)模血漿中大量蛋白質(zhì)的水平,以深入了解人類(lèi)疾病和其他表型。

deCODE基因公司的科學(xué)家們使用了血漿中的5000種蛋白質(zhì),這些蛋白質(zhì)以群體規(guī)模的多重平臺(tái)為目標(biāo),以解開(kāi)它們的遺傳決定因素以及它們與人類(lèi)疾病和其他特征的關(guān)系。

利用技術(shù)平臺(tái)“SOMAscan”的蛋白質(zhì)組學(xué)測(cè)定法測(cè)量的血漿蛋白質(zhì)水平,deCODE基因公司的科學(xué)家們測(cè)試了2700萬(wàn)個(gè)序列變異與35559名冰島人血漿中4719種蛋白質(zhì)水平的關(guān)聯(lián)。他們發(fā)現(xiàn)了18084個(gè)序列變異與蛋白質(zhì)水平之間的關(guān)聯(lián),其中19%與通過(guò)全基因組測(cè)序確定的罕見(jiàn)變異相關(guān)??傮w而言,93%的關(guān)聯(lián)是新穎的。此外,他們分別基于“SOMAscan”方法和基于抗體的OLINK精準(zhǔn)蛋白質(zhì)組學(xué)分析,從現(xiàn)有最大的血漿蛋白質(zhì)組學(xué)研究中重復(fù)了83%和64%的報(bào)告關(guān)聯(lián)。

科學(xué)家們測(cè)試了血漿中蛋白質(zhì)水平與373種疾病和其他特征的關(guān)聯(lián),并產(chǎn)生了257490個(gè)這樣的關(guān)聯(lián)。他們整合了序列變異與蛋白質(zhì)水平、疾病和其他特征的關(guān)聯(lián),發(fā)現(xiàn)已報(bào)告的與疾病和其他特征相關(guān)的大約5萬(wàn)個(gè)變異中的12%,也與蛋白質(zhì)水平相關(guān)。

deCODE基因公司首席執(zhí)行官、該論文的資深作者之一凱瑞·斯蒂凡森表示,蛋白質(zhì)組學(xué)可以幫助解決遺傳研究中的一個(gè)主要難題:確定哪個(gè)基因負(fù)責(zé)序列變異對(duì)疾病的影響。此外,蛋白質(zhì)組還提供了一些時(shí)間相關(guān)的測(cè)量方法,因?yàn)檠褐械牡鞍踪|(zhì)水平會(huì)隨著事件發(fā)生和發(fā)生的時(shí)間而上升和下降。

關(guān)鍵詞: 血漿蛋白質(zhì)組研究 人類(lèi)疾病 RNA表達(dá) 組學(xué)分析

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